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病源及发病规律银杏茎腐病，又叫苗枯病，是银杏苗期的主要病害，苗木受害主要发生在夏季（6至9月）。此时天气炎热，土壤温度高，苗木茎基部受损伤后易引发此病。苗木木质化程度越低、发病率越高，地势低洼、长期积水的育苗地，苗木生长不良，发病更为严重。一般来说，病菌侵染自6月中旬开始，直至9月中旬才停止，7至8月为发病盛期。
为害症状此病多出现于1年生的银杏播种苗，常造成幼苗生长不良。发病初期幼苗近地表茎基部外皮出现黑褐色，逐渐内陷皱缩，内皮层输导组织坏死腐烂，皮层与初生木质部脱落，皮层呈海绵状或粉末状。严重时木质部也腐烂成褐色束状，叶片失去正常绿色，逐渐萎蔫下垂，但不脱落，最后导致全株死亡。2年生苗木在病害大量发生时也常感病，但抗性比1年生苗木强，受害病株在根颈处尚能萌发新芽。银杏扦插苗在高温或低温的条件下，也常发生茎腐病，发病时，插穗表皮呈筒状套在木质部上，韧皮部薄壁组织则全部发黑腐烂。
综合防治该病以预防为主，进行综合防治。
1. 农业防治：（1）提早播种，争取在土壤解冻时（3月上中旬）即行播种，待6月发病高峰到来之际，苗木已呈木质化，抗病力增强，抑制病菌，降低发病率。（2）合理密播，利用其相互遮荫的特性来降低地温，可大幅度减少银杏茎腐病发生。（3）在苗圃间植高秆作物，利用其遮荫；或加强喷水、灌水，以降低地温，有效减少银杏茎腐病的发生。（4）播种前精细耕地，并及时杀灭地下害虫；加强苗床期管理，防止苗木机械受损，及时拔除病株和清理病株穴。
2. 生物防治：苗木发病前（6月中旬），追施充分腐熟的棉籽饼、豆饼或草木灰、过磷酸钙混施（草木灰与过磷酸钙施用比例为4：1），同时加入拮抗性放线菌，能有效地抑制病菌蔓延扩散，大大降低苗木发病率。
3.化学防治：整地时，每亩地施入50千克至100千克硫酸亚铁，或用2％至3％的硫酸亚铁溶液喷洒土壤。发病初期，可叶面喷洒1％至2％的硫酸亚铁溶液。5月下旬、6月上旬、6月中旬各喷一次50％多菌灵600至700倍液或甲基托布津800至1000倍液等。在喷药防治过程中，可喷一些植物叶面肥如爱多收、磷酸二氢钾等，提高植株抗病能力，有效防止银杏茎腐病扩散蔓延。
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